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（1）迟放性。大多数行政管理活动，特别是有关国家和社会发展的重大管理活动，一般不是短时间内就能明显见效的，其行政效率短期内无法准确考察。
（2）综合性。由于行政管理所涉及的问题十分庞杂，包括了社会生产和社会生活的各个方面，用任何单一的指标，孤立的因素，都不能全面反映行政效率，必须对其进行高度综合。
（3）多层次性。行政管理的复杂性和多样性决定了行政效率的多层次性。从行政效率的范围看，可分为宏观效率和微观效率，前者是全局性的，后者是局部性的；从行政效率形式看，可分为具体行政效率和抽象行政效率，前者是由具体行政行为产生的，后者是由抽象行政行为产生的；从行政组织结构的层次看，可分为决策效率、管理效率和执行效率。决策效率是指决策部门即领导层的工作效率，管理效率是指中层干部解决和组织管理问题的效率，执行效率是指基层工作人员的工作效率。
行政效率的特点决定了它不单纯是个数量的概念，而是行政管理各种因素和手段的综合反映，是行政活动数量和价值的统一。衡量行政效率的高与低，要作定量分析和对比，凡用最少的人力、物力、财力和时间，取得最大的效果，效率就高，反之则低。同时还要考虑社会的和政治的价值因素，看其是否达到了有益于社会的既定目的，是否具有为大多数人谋福利的民主价值。
这两个方面是缺一不可的。不计算数量，就会出现诸如机构臃肿、人浮于事、劳民伤财等弊端，不能调动人的积极性，也就没有行政效率。不讲价值，一味追求数量上的高效率，不顾政治影响、社会信誉和伦理道德，甚至损害人民的利益，这种高效率不仅无益，反而有害。